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1,3-环己二酮是合成农药和医药的中间体，广泛应用于化工、医药、农药、航天等领域。环己二酮类化合物具有杀虫、除草、杀菌及生长调节等广泛的生物活性，含有1,3-环己二酮结构的化合物多用于农药活性的研究。
美国***胺公司和德国拜耳公司合成2-羟基-6-氧代-1-环己烯基-1-酰胺类化合物，研究了该类化合物的杀虫活性，在1mg/L时对蚊子幼虫的杀虫活性为100%。该类化合物的结构构造主要是在环己烷和苯环上进行了各种取代基的变换。
1,3-环己二酮对螨类、粘虫、甲虫、家蝇具有防治效果，同时还具有除草活性。