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戊二醛被誉为是继甲醛和环氧乙烷消毒剂之后化学消毒灭菌剂发展史上的第三个里程碑。戊二醛属高效消毒灭菌剂，具有杀菌谱广、杀灭细菌芽孢效果可靠，杀菌作用受有机物的影响小、对金属的腐蚀性小等特点。适用于不耐热的医疗器械和精密仪器的消毒灭菌，尤其是内窥镜的消毒灭菌。通常是用2%的戊二醛溶液浸泡或擦拭进行消毒灭菌。卫生部的《消毒技术规范》规定：对医疗器械的灭菌处理，需用2%的戊二醛溶液浸泡10小时；对一般细菌繁殖污染物的消毒，需用2%的戊二醛溶液浸泡或擦拭10分钟；对肝炎病毒污染表面的消毒，需用2%的戊二醛溶液浸泡或擦拭30分钟；还用于环境消毒。也用于与其它活性成分复配使用。