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测序样品相关说明
样品类型
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注意事项
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细菌
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1.通用载体或自己构建的载体,都请注明载体名称、抗生素类型以及具体测序引物。
2.我们提供Amp,Kan,Tet及Chl四种抗生素;特殊抗性、特殊培养条件的样品,请您提供已经培养好的5ml新鲜菌液或沉淀好的菌体。
3.如果是病毒(包括噬菌体)DNA,低拷贝质粒以及BAC DNA,请您纯化好模板直接用于测序。
4.建议您提供穿刺菌。如果是菌液则必须是新鲜的;加甘油后冷冻保存的菌株请您复苏后再提供。
5.样品太少会导致培养时间过长甚至出现培养细菌失败,以至延误您的实验,所以提供的菌液至少200ul以上。
6.务必注明是否有特殊结构:GC rich;GC cluster、Poly(A)、Poly(T)、重复序列及引物同源序列等。
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质粒
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1.为确保测序的成功率和质量,建议您尽量提供菌种测序。
2.因特殊原因只能提供质粒模板测序时,必须保证质粒是高纯度的,而且须溶解在灭菌的去离子水中而不是TE中。浓度大于100ng/ul,体积10ul以上,注明抽提方法。
3.如果是病毒(包括噬菌体)DNA,低拷贝质粒以及BAC DNA,请纯化好模板直接用于测序。
4.插入片段有特殊结构时必须注明,特别是含有通用引物的同源序列。
5. 务必注明是否有特殊结构:GC rich;GC cluster、Poly(A)、Poly(T)、重复序列及引物同源序列等。
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PCR产物
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1.原则上收取高质量的PCR原液, 片段大小为200~1500bp。
2.取3ul原液电泳检测,为明亮单一条带。
3.提供未纯化产物测序,PCR原液不少于50ul;须注明产物的体积、片段大小、浓度,是否经过Agarose胶纯化。
4.提供已纯化的产物测序,体积不少于15ul,PCR产物须溶解在灭菌的去离子水中而不是TE中;注明提供PCR产物的体积、片段大小、浓度,是否经过Agarose胶纯化。
5.提供的测序引物,浓度不低于5pmol/ul(5umol/L),要求PAGE纯化,体积15ul以上,样品多将适当增加量。
6. 务必注明是否有特殊结构:GC rich;GC cluster、Poly(A)、Poly(T)、重复序列及引物同源序列等。
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备注
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我们为您提供的免费通用测序引物信息。
2.随机引物(RAPD)、含简并碱基或长度小于15的引物不适合用于测序。
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三、测序报告说明
1.提供报告的形式:
结果出来的第一时间我们将用email 将序列发到您的信箱,随后送出测序报告。测序报告包括彩色图谱一份和相应序列文本。
对于15个以下的测序,在提供书面报告的同时会提供一张软盘,里面包括Chromes软件、序列和图谱文件。
大量测序的报告将采用光盘的形式提供结果,并附上一些最常用的序列分析软件。
2.查看测序报告方法:
先阅Chromes软件及其补丁使用方法文档。
运行Chromes补丁等程序(否则软件60天试用期过后,将只能打开图谱,而不能进行其他任何操作).
3.特殊情况的说明:
下列特殊情况下只发E-mail不提供测序报告(不收费):
下列特殊情况下只发E-mail不提供测序报告(不收费):
应信号极弱甚至没有反应信号。
信号极其杂乱,无法得到有用信息。
由于DNA结构上的原因,有时会出现反应中途无法进行之情况。如:GC rich;G、C cluster;Poly(A)、Poly(T)的连续结构等。此外,另一种情况为反应中途出现套峰现象。此种情况一般为由于DNA结构中的重复序列,造成测序用引物和模板之间有二个以上的结合点。以上为由于DNA结构原因造成了无法正常进行DNA测序,对这种情况我们须按照正常反应收费。出现以上情况后我们提倡从另一个方向进行测序。
如DNA本身或引物等的原因,测序反应从开始就无法进行,此时按反应失败计算。反应失败保证做第二次。如第二次同样情况失败。按标准收费的半价收费。