报告指出，功能性低聚糖与菊粉，膳食纤维和糖醇一起作为益生元最重要的组成部分，自从1996年保龄宝生物股份有限公司大量生产功能性低聚异麦芽糖产品以来，中国功能性低聚糖市场取得了迅猛的发展，在生产成本方面具有较大的优势，但相对于美国、日本、欧洲市场，中国的功能性低聚糖行业仍处在初级阶段。 由于在高附加值产品生产以及售后服务方面的不足，中国低聚糖行业仍然处于全球产业价值链的低端。
报告统计数据显示，目前中国是全球主要的功能性低聚糖生产基地和新兴的消费市场，2008年中国功能性低聚糖生产占到全球总量的30%左右。目前中国大约有70个功能性低聚糖制造商， 2010年行业总产能达到30万吨左右，行业总产量只有大约12万吨，行业销售额达到3.5亿美金。低聚异麦芽糖，低聚果糖，低聚木糖，大豆低聚糖，低聚麦芽糖是中国主要功能性低聚糖产品，它们2010年总产量超过了11万吨。中国大部分功能性低聚糖产品采用酶法生产，仅仅少数的功能性低聚糖制造采用提取法。
报告研究表明，由于功能性低聚糖生产原材料之间的差异，中国大部分功能性低聚糖制造商最多能生产1到2种功能性低聚糖。大多数的功能性低聚糖生产商集中分布在原材料丰富的地区，如山东、山西、江苏、浙江和广东。目前中国功能性低聚糖行业呈现行业整合的态势，少数行业龙头企业市场占有率不断提高，保龄宝生物股份有限公司、江门量子高科生物有限公司，山东龙力生物科技股份有限公司等是中国功能性低聚糖行业的领军企业。
得益于明显的益生功能，功能性低聚糖在中国的应用得到了快速的发展，应用领域涉及乳制品，保健品，食品，饲料，饮料等行业。糖醇，蔗糖，菊粉是功能性低聚糖主要的竞争性产品，彼此在不同下游消费领域优劣势并存。
西美信息研究员谢淼波表示：由于市场需求的蓬勃发展，中国功能性低聚糖行业将能吸引更多投资者的目光。另外中国低聚糖行业整合步伐将加快，龙头企业将加快产业链整合和提升高附加值功能性低聚糖增加。同时建议投资者理性面对人民币升值，新劳动法实施，全球经济危机引起的生产成本上涨带来的投资风险。
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